Der Zyprische Fußballpokal 1949/50 war die 13. Austragung des zyprischen Pokalwettbewerbs. Er wurde vom zyprischen Fußballverband ausgetragen. Das Finale fand zunächst am 18. März 1950 im GSP-Stadion von Nikosia statt, musste aber aufgrund von Ausschreitungen am 23. April 1950 an gleicher Stelle wiederholt werden.
Alle Begegnungen wurden in einem Spiel ausgetragen. Bei unentschiedenem Ausgang wurde das Spiel um zweimal 15 Minuten verlängert. Stand danach kein Sieger fest, folgte ein Wiederholungsspiel auf des Gegners Platz.
Acht Minuten vor Spielende führte Anorthosis mit 1:0. EPA bekam einen Elfmeter zugesprochen, mit dem sie den Ausgleich schafften. Der Schiedsrichter ordnete jedoch eine Wiederholung des Elfmeters an und der EPA-Fußballer verfehlte. Dies veranlasste die EPA-Fans, auf das Spielfeld zu stürmen. Das Spiel wurde abgebrochen. Der zyprische Fußballverband entschied über eine Wiederholung des Spiels am 23. April 1950 an gleicher Stelle.